En Underwater Cities, que toma alrededor de 30-45 minutos por jugador, los jugadores representan los cerebros más poderosos del mundo, cerebros nominados debido a la sobrepoblación de la Tierra para establecer las mejores y más habitables áreas submarinas posibles. El principio principal del juego es la colocación de cartas. Tres cartas de colores se colocan a lo largo del borde del tablero principal en 3 x 5 ranuras, que también están coloreadas. Idealmente, los jugadores pueden colocar cartas en ranuras del mismo color. Luego pueden realizar tanto acciones como obtener ventajas: la acción representada en la ranura del tablero principal y también la ventaja de la carta. Las acciones y ventajas pueden permitir a los jugadores obtener materias primas; construir y mejorar cúpulas de ciudades, túneles y edificios de producción como granjas, dispositivos de desalinización y laboratorios en su área submarina personal; mover su marcador en la pista de iniciativa (lo cual es importante para el orden de los jugadores en el siguiente turno); activar las "cartas A" del jugador; y recolectar cartas, tanto especiales como básicas que permiten mejores posibilidades de decisión durante el juego. Todas las casi 220 cartas, ya sean especiales o básicas, se dividen en cinco tipos según la forma y el momento de uso. Se planea que las áreas submarinas sean de doble cara, brindando a los jugadores muchas oportunidades para lograr puntos de victoria (VPs) y finalmente ganar.